無論是開式冷卻塔還是閉式冷卻塔，由于長年暴露在室外，風機自身的吸附力會攜帶大量的泥沙進入塔內，造成填料及管道的堵塞，時間長了就會影響冷卻塔自身的降溫能力，所以定期的維護與清理也是冷卻塔廠家在使用產品時必不可少的一環。

我們通常視為兩種情況，一是在正常的停機狀態下進行清洗，大概的流程就是：水沖-殺菌滅藻劑-清洗劑除垢清洗-清洗后沖洗-預膜-清洗后的清理，大概就是這樣一個流程，具體的操作還是需要找到冷卻塔廠家進行處理，不建議自行清洗，以免對冷卻塔造成損壞。

第二種就是我們說的不停機清洗，在冷卻塔正常工作的狀態下，把中性清洗劑加入冷卻水中，循環30天左右把清洗液排出，加上保養劑，就完成了不停機的清洗工作，這種方案時間會很長，但是可以在整個機組正常運行狀態下進行，且不會影響正常的運行。這種清洗有幾個好處：中性清洗劑沒有腐蝕性，清洗效率高，操作簡單。